Antes de que se inventara la técnica de secuenciación del ADN, estos microorganismos eran clasificadas acorde a sus formas, método que también es conocido como Morfología. En la actualidad, sumado al método de la morfología, también se utiliza la secuenciación del ADN, asegurando un efectivo método para clasificar a las bacterias. Otros métodos de clasificación incluyen las actividades metabólicas, las condiciones requeridas para su crecimiento, o bien sus reacciones bioquímicas.
Hay varios grupos de bacterias que pertenecen a la misma familia y que han evolucionado de la misma bacteria aunque, de cualquier manera, cada tipo de bacteria posee características propias que las particularizan. Veamos cómo es la clasificación de las bacterias según su forma